水稻是從苗期到抽穗期都可能會(huì)發(fā)生惡苗病，通常會(huì)出現(xiàn)3個(gè)比較明顯的發(fā)病高峰期。在種植之后的半個(gè)月左右會(huì)出現(xiàn)個(gè)感染病害的高峰，在水稻分蘗高峰期會(huì)出現(xiàn)第二個(gè)發(fā)病旺盛峰，在水稻孕穗期會(huì)出現(xiàn)第三個(gè)染病害的旺盛峰。在前兩個(gè)高峰期感染病害比較嚴(yán)重。帶病菌的作物種子是水稻感染惡苗病的主要傳染源，其次是病稻草。惡苗病病菌主要是以分生孢子粘附著在種子表面或是以菌絲體潛伏到種子內(nèi)過冬。播種病谷或是使用感染病害的稻草來覆蓋進(jìn)行催芽，都將會(huì)引起幼苗發(fā)病。在苗期感染病害，病苗將會(huì)比健苗細(xì)高，發(fā)病苗葉片、葉鞘較為細(xì)長，葉色呈現(xiàn)淡黃，根系發(fā)育不正常，某些感染病害的作物苗在移栽前后不久就會(huì)死亡。病死的作物表面上會(huì)出現(xiàn)分生孢子，此可以通過風(fēng)雨蔓延到無病害感染的幼苗上，從傷口侵入，導(dǎo)致多次再次侵染。但是此種再侵染能力相當(dāng)弱，在田間侵染健康稻苗的可能性非常小。
在播種之前使用藥液進(jìn)行浸種是惡苗病的為有效的措施，適宜使用的藥劑有氰烯菌酯、乙蒜素以及咪鮮胺等。但是用藥量太低或是用藥的濃度太低將會(huì)造成防治效果降低，導(dǎo)致發(fā)生惡苗病。使用藥液進(jìn)行浸種的時(shí)間太短，也會(huì)造成防治效果下降。某些地區(qū)的水稻惡苗病病原菌會(huì)對(duì)咪鮮胺產(chǎn)生抗性，在這些地區(qū)，適宜更換使用氰烯菌酯、乙蒜素以及咯菌腈等藥進(jìn)行浸種。在給水稻進(jìn)行浸種的過程中，病種子上的病菌將會(huì)污染到?jīng)]有染病的種子。